Mugen vahşi, düşüncesiz ve kadın düşkünü bir hayduttur. Jin ise gezgin bir ronin - gizemli, geleneklere bağlı, terbiyeli ve çok güçlü bir savaşçı. Bir tesadüf eseri karşılaşırlar ve dövüşürler; ancak birbirlerini altedemezler ve bu sırada çıkan yangın yüzünden yakalanırlar. İkilinin yolları kendilerini idam edilmekten kurtaran Fuu ile kesişir. Fuu ikisini, kendisine "ayçiçeği gibi kokan" gizemli bir samurayı aramasında yardımcı olmaları için ikna eder ve yolculukları başlar....

Himura Kenshin, Meiji Devrimi sırasında devrimciler için bir çok adam öldürmüş bu yüzden de “Hitokiri Battousai” adını almış usta bir suikastçıdır. Devrim bittikten sonra bir daha asla öldürmeyeceğine yemin eder ve bir rurouni(gezgin) olarak seyahat etmeye başlar. Seyahati sırasında yanlış bir anlaşılma nedeniyle Kaoru Kamiya ile tanışır ve Kaoru’ya babasından kalan Dojo da geçici olarak yaşamaya başlar. Kenshin geçmişinin onu asla bırakmayacağını ve nerede olursa olsun nereye giderse gitsin hep...

Yukimura Chizuru Edo'da çalışan bir doktorun kızıdır. Babası bir gün gönüllü doktor olarak, tek başına Kyoto'ya gider. Zaman içersinde babasından haber alamayan Chizuru, kaygılanmaya başlar ve Kyoto'ya, onu aramaya yola cıkar. Yolculuk esnasında Chizuru bir grup suçlunun saldırısına uğrar ve onların Shinsengumi üyeleri ile olan çatışmasına tanık olur. Onu kurtarıp, koruması altına alan Shinsengumi, kendi arasında Chizuru'yu ne yapacaklarını tartışırken, Chizurunun aynı zamanda kendilerininde ara...

Tarihte, 260 yıl süren Edo Devri kapanır ve Meiji Devri başlar. Fakat; yeni hükümetin askerleriyle eski Tokugawa muhafızları arasındaki acı çekişmeler devam etmektedir. Shinsengumi'nin sağ kalan üyeleri, Tobafushimi'deki yenilgilerinden sonra yaralarını sarmaya çalışırlar ve Kouyou Chinbutai birliği olarak Koufu Kalesini korumak için Shogun'lukla (Bakufu) anlaşırlar. Bakalım batılı silahlar mı üstün gelecek yoksa Samurai kılıçları mı....?

Yıl 1863. Fırtınalı samuray dönemi sona erer ve Japonya mutlak irade yandaşları ve karşıtları olarak ikiye ayrılır. Dünyanın kaderi, tarihin akışını değiştirmek için gelecekten gönderilen tarihi revizyonist bir ordu tarafından tehdit edilir. Bu kuvvetleri yenmek ve gerçek tarihi korumak için ruhları Saniwa tarafından hayata getirilmiş olan iki kılıç savaşçısı Edo'ya akın eder. Aynı efendiye hizmet eden nazik ve düşünceli Horikawa Kunihiro ile öfkeli ama yetenekli Izuminokami Kanesada; Mutsunokam...

Denizin öteki tarafından gelen korkunç bir kral! Angolmois: Genkou Kassenki Ortaçağ Japonya'sını en derinden sarsan ''Genkou'' olarak adlandırılan olayı Samurayların doğuşu ile birlikte tüm gerçeklikleri ile anlatıyor.

868 Baharı, Tokugawa Hanedanlığın son yılları; Bakumatsu dönemi. Batılaşmanın etkisi ile Tokugawa Hanedanlığı, gücünü yavaş yavaş yitirmektedir. İç savaş tehdidi, karmaşa ve politik çekişmeler, yaklaşan bir devrimin habercisi gibidir. Tüm bunlar yaşanırken ortaya bir güç “Hasha no Kubi” çıkar. Her kim ona sahip olursa, tüm ülkeyi yöneteceği söylenmektedir. Bazıları çıkarları için, bazıları intikamları için ona sahip olmak istemektedir. Fakat, başka bir güç de, gölgeler içinde ona karşı durmaktad...

Koga ve Iga klanları, kaderleri savaşmak olan ve 400 senedir savaşan iki ninja klanıdır ve bu klanlardaki kişiler doğa üstü yeteneklere sahiptirler. Koga Klanından Gennosuke ve Iga Klanından Oboro birbirlerine aşıktırlar ama kaderlerinde savaşmak vardır. İkisi de manasız savaşı sürdürmek istemeseler de, kendilerinin de içinde bulunduğu, her iki klandan seçilmiş 10'ar kişi bu savaşı sürdürürler.

Hakuouki filmlerinin ikinci bölümüdür. İlk filmin devamı.

Sekigahara savaşını konu alan seride, birçok ünlü tarihi karakterle birlikte, olabildiğince gerçekler baz alınarak kurgulanmıştır.